El Rectorado se encuentra en la antigua sede de la Facultad de Veterinaria, un bello edificio neomudéjar, ubicado en la Avenida de Medina Azahara, siendo uno de los inmuebles emblemáticos de la ciudad. El Ayuntamiento de la ciudad ordenó construir el edificio en 1914 con el objeto de albergar la Facultad de Veterinaria. Éste es considerado por los historiadores del arte como la “obra de mayor compromiso con estilo regionalista construida en Córdoba”. Durante las obras de adaptación del inmueble como nuevo Rectorado fue descubierto junto a sus cimientos el anfiteatro romano de Corduba, fechado en la primera mitad del siglo I a.C. y considerado el de mayores dimensiones de toda la Hispania Romana. La reforma del edificio ha posibilitado dotar a los servicios centrales de la UCO de modernas instalaciones que cuentan con la más avanzada tecnología.